微波殺菌設(shè)備是利用了電磁場的熱效應(yīng)和生物效應(yīng)的共同作用的結(jié)果。微波對細菌的熱效應(yīng)是使蛋白質(zhì)變化，使細菌失去營養(yǎng)，繁殖和生存的條件而死亡。微波對細菌的生物效應(yīng)是微波電場改變細胞膜斷面的電位分布，影響細胞膜周圍電子和離子濃度，從而改變細胞膜的通透性能，細菌因此營養(yǎng)不良，不能正常新陳代謝，細胞結(jié)構(gòu)功能紊亂，生長發(fā)育受到抑制而死亡。此外，微波能使細菌正常生長和穩(wěn)定遺傳繁殖的核酸RNA和脫氧核糖核酸DNA，是由若干氫鍵松弛，斷裂和重組，從而誘發(fā)遺傳基因突變，或染色體畸變甚至斷裂。

　　微波殺菌設(shè)備是通過特殊熱和非熱的效應(yīng)殺菌，與常規(guī)熱力殺菌比較，能在比較低的溫度和較短的時間獲得所需的消毒殺菌效果。一般殺菌溫度在75-80攝氏度，就能達到效果，此外微波處理食品能保留更多的營養(yǎng)成分和色、香、味、形等風(fēng)味，具有膨化效果。如常規(guī)熱力處理的蔬菜保留的維生素C是46％-50％，而微波處理是60％-90％；常規(guī)加熱豬肝維生素A保持率為58％，而微波加熱為84％。常規(guī)熱力殺菌是通過熱傳導(dǎo)，對流或輻射等方式將熱量從食品表面?zhèn)髦羶?nèi)部，要達到殺菌溫度，往往需要較長時間。微波殺菌設(shè)備是微波能與食品及其細菌等微生物直接相互作用，熱效應(yīng)與非熱效應(yīng)共同作用，過到快速升溫殺菌目的，處理時間大大縮短，各種物料的殺菌作用一般在3-5分鐘。

　　微波殺菌設(shè)備在進行微波干操殺菌處理時，設(shè)備能即開即用，沒有常規(guī)熱力殺菌的熱慣性，操作靈活方便，微波功率可調(diào)，傳輸速度從零開始連續(xù)可調(diào)，便于操作。常規(guī)熱力殺菌是從物料表面開始，然而通過熱傳導(dǎo)至內(nèi)部，存在內(nèi)外溫差。為了保持食品風(fēng)味，縮短處理時間。往往食品內(nèi)部沒有達到足夠溫度而影響殺菌效果。由于微波具有穿透作用，對食品進行整體處理時，表面和內(nèi)部同時受到作用，所以消毒殺菌均勻*。